Para configurar lo es muy sencillo, cuando el xpadder se abre aparece la siguiente ventana
Damos clic para configurar y se abre la ventana de la imagen de abajo, en esta solo tenemos que seleccionar el tipo de botón de nuestro control que queremos configurar como por ejemplo: el joystick, los gatillos o los botones normales.
Una ves seleccionado el tipo de botón que vamos a configurar, los oprimimos en el control e irán apareciendo, también aquí los podemos mover para que queden acomodados como mas nos guste
Regresamos a la primer ventana y damos clic sobre algún botón y se abre una ventana con un teclado para programar la tecla que queramos como se muestra a continuación.
Y ya con esto tenemos nuestro gamepad configurado para que funcione en lugar de algunas teclas del teclado